Windows Creators Updateが適用されはじめてから、こういう現象に悩まされる方が増えました。原因にいくつかのパターンがあります。

1. ウィルスセキュリティソフトをWindows Creators Update対応版にせずにそのまま使い続けている。
2. Windows 7、Windows 8からのアップグレードでパーティションが細かく仕切られている。
3. Windows 7、Windows 8のころにデュアルブートで使用していたが、現在もデュアルブートで使用している。

1.Creators Update(Fall Creators Update）では、ランサムウェア対策でフォルダのアクセス権が変わりました。ウィルスセキュリティソフトを最新版にアップデートすることで解消します。
2.Microsoftから公式な見解はありませんが、古いPCでパーティションが細かく仕切られていると、パーティションが上手く認識されず、ファイルアクセスに異様に時間が掛かることがあります。PCの型番にも左右されますが、Windows Creators Update以降は、パーティションが細かく仕切られていることを好まないようです。パーティションが細かく仕切られていると、PCのリカバリツールで工場出荷状態に戻すことが出来ませんので、HDDのパーティションを真っ新にして、Windows 10をクリーンインストールすることで解決します。その場合、

FAQ「Windows 10をクリーンインストール方法と手順を教えてください。また、ライセンスはどうなりますか。」をご覧下さい。

3.は基本的に2と同じ原因です。対策も同じになります。Windows Creators Update以降はデュアルブートを考慮していないようです。素直にシングルブートにしましょう。